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Calculateur d’indices de biodiversité
Collez une liste de taxons et de leurs abondances d’un échantillon - une entrée par ligne, par ex. Baetidae 12. Le calculateur obtient l’indice de Shannon-Wiener (H'), l’indice de Simpson et l’équitabilité de Piélou (J).
Collez au moins deux taxons avec leurs abondances.
Comment nous calculons
Pour N individus dans S taxons, où pi est la proportion du taxon i (ni/N) :
Shannon-Wiener : H' = −Σ pᵢ × ln(pᵢ)
Piélou (équitabilité) : J = H' / ln(S)
Simpson (dominance) : D = Σ pᵢ² - plus il est élevé, plus la dominance de taxons individuels est forte
Simpson (diversité) : 1 − D - plus il est proche de 1, plus la diversité est grande
Questions fréquentes
Dans quel format coller les données ?
Une entrée (taxon) par ligne, le nom et l’abondance séparés par une espace, une tabulation ou une virgule - par ex. « Baetidae 12 » ou « Baetidae, 12 ». L’ordre importe peu et les lignes vides sont ignorées.
En quoi Shannon diffère-t-il de Simpson ?
L’indice de Shannon (H') est sensible au nombre de taxons et à leur équitabilité - il augmente quand l’échantillon a plus de groupes d’abondance semblable. L’indice de Simpson donne plus de poids à la dominance - il réagit fortement quand un taxon prédomine nettement, même si le reste est divers.
Que montre l’indice de Piélou (J) ?
L’équitabilité - le rapport entre le H' mesuré et le H' maximal possible pour ce nombre de taxons (soit ln(S)). Un J proche de 1 signifie que les abondances des taxons sont semblables ; un J proche de 0 signifie une forte dominance d’un ou de quelques taxons.
Quel est le lien avec le BMWP-PL ?
Le BMWP-PL parle de la qualité de l’eau à partir de la PRÉSENCE de familles sensibles à la pollution. Les indices de diversité parlent de la STRUCTURE et de l’état de la communauté - si elle est dominée par quelques taxons ou diverse. Les mêmes données (une liste de taxons et d’abondances) peuvent se calculer avec les deux outils - ils donnent une information différente et complémentaire.
La composition de l’échantillon d’une saison à l’autre
La valeur des indices de diversité ne se voit qu’en comparant - le même emplacement, des saisons successives. Dans LimnoLog, vous enregistrez les abondances des taxons comme paramètres personnalisés et voyez comment la structure de la communauté change dans le temps.
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